A list with parameters customizing ggmetanet representation (see ggnet documentations)

ggnet.default

Format

An object of class metanetwork_config of length 16.

Examples

# display all default settings
ggnet.default
#> $label
#> [1] TRUE
#> 
#> $label.size
#> [1] 3
#> 
#> $max_size
#> [1] 5
#> 
#> $edge.size
#> [1] 0.5
#> 
#> $arrow.size
#> [1] 6
#> 
#> $arrow.gap
#> [1] 0.015
#> 
#> $alpha
#> [1] 0.8
#> 
#> $edge.alpha
#> [1] 0.5
#> 
#> $alpha_diff
#> [1] 0.8
#> 
#> $edge.alpha_diff
#> [1] 0.8
#> 
#> $size.cut
#> [1] 5
#> 
#> $palette
#> [1] "Set2"
#> 
#> $default.color
#> [1] "grey75"
#> 
#> $legend.position
#> [1] "bottom"
#> 
#> $legend.big.nets
#> [1] TRUE
#> 
#> $img_PATH
#> NULL
#> 
#> attr(,"class")
#> [1] "metanetwork_config"

# create a new settings
ggnet.custom = ggnet.default
ggnet.custom$edge.size = 2
ggnet.custom
#> $label
#> [1] TRUE
#> 
#> $label.size
#> [1] 3
#> 
#> $max_size
#> [1] 5
#> 
#> $edge.size
#> [1] 2
#> 
#> $arrow.size
#> [1] 6
#> 
#> $arrow.gap
#> [1] 0.015
#> 
#> $alpha
#> [1] 0.8
#> 
#> $edge.alpha
#> [1] 0.5
#> 
#> $alpha_diff
#> [1] 0.8
#> 
#> $edge.alpha_diff
#> [1] 0.8
#> 
#> $size.cut
#> [1] 5
#> 
#> $palette
#> [1] "Set2"
#> 
#> $default.color
#> [1] "grey75"
#> 
#> $legend.position
#> [1] "bottom"
#> 
#> $legend.big.nets
#> [1] TRUE
#> 
#> $img_PATH
#> NULL
#> 
#> attr(,"class")
#> [1] "metanetwork_config"