Post-doc at Alpine Ecology Lab, Grenoble, France.
My research focuses on the modelling of interaction networks in ecology, at the crossroads between community ecology, statistics and computer science, and aims to enhance the interactions between these disciplines.
General research topics
I am interested in the development of methods to represent, infer and analyze the structure and dynamics of interaction networks. If the developed methods have a rather general scope in ecology, I focus on their application to soil ecology on environmental DNA data from the ORCHAMP observatory program. In particular, I develop and implement:
network comparison methods and diversity indices
methods for inferring statistical associations between species distributions
food web representation methods based on diffusion algorithms
spatially explicit metacommunity models by integrating spatial and interaction networks
Chercheur en post-doctorat au Laboratoire d’Ecologie Alpine.
Mes travaux de recherche portent sur la modélisation des réseaux d’interactions en écologie; ils se placent à l’intersection de l’écologie des communautés, des statistiques et de l’informatique et visent à approfondir le dialogue entre ces disciplines.
Thèmes généraux de recherche
Je m’intéresse au développement de méthodes qui permettent de représenter, d’inférer et d’analyser la structure et la dynamique des réseaux d’interactions. Si les méthodes développées ont une portée assez générale en écologie, je m’attache à leur application à l’écologie du sol sur des données d’ADN environnemental issues de l’observatoire ORCHAMP. En particulier, je développe et implémente :
des méthodes de comparaison de réseaux et des indices de diversité
des méthodes d’inférence d’associations statistiques entre distributions d’espèces
des méthodes de représentation de réseaux trophiques basées sur des algorithmes de diffusion
des modèles de métacommunautés spatialement explicites en intégrant réseaux spatiaux et d’interactions